分支结构包括分支页面的层次、各页面间的关系。设计制作网站时，应将网站中的各元素存放在站点文件夹中。
在站点文件夹内，则根据网站的大小设计分支结构的文件夹，用于将不同类型的网页分门别类地进行存放，以便于使用和管理。分支页面的内容要相对独立，切忌重复，并能通过导航按钮方便地与本分支中的其他页面、首页、其他分支页面进行转换。
设计分支结构时，应根据网站页面文件的多少，选择是否需要设计分支文件夹。例如，一个介绍旅游资源的网站，可以根据每一个旅游点,在站点的根文件夹下创建对应的分支文件夹，每个分支文件夹内存放一个相应旅游点介绍的页面文件和相关图片文件，这些分支文件夹的命名可以旅游点的中文拼音命名。如果按照地区对旅游点进行分类，则可以根据每一个地区在站点的根文件夹下创建第一分支文件夹， 然后在每一个分支文件夹下创建对应于每一个旅游点的第二分支文件夹。总之，分支结构应合理，应能满足站点对文件管理的需要。
